Сюжет построен вокруг крупного спортивного события, которое запланировано в Токио (Япония). Специально к этому мероприятию был сконструирован фирменный поезд «Японская пуля», который по вакуумной трубе должен мчаться со скоростью 1000 км/час из Син Нагоя в Токио в день церемонии открытия. На вечеринке, на которой собрались важные гости, меценаты и спонсоры, происходит похищение. За дело берется главный герой — детектив Конан, который сразу проводит параллели не только с новым построенным поездом и готовящимися играми, но и с похожими событиями, произошедшими в Бостоне 15 лет назад.
